Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FARP1Q9Y4F1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms