Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRELID3BQ9Y3B1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms