Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED5Q9Y3A6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms