Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms