Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHANK2Q9UPX8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SHANK2Q9UPX8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms