Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX7Q9UNH6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms