Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP18Q9UMW8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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