Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM4Q9UKN5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms