Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN4Q9UJW0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms