Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPN3Q9UHW5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms