Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMPXQ9UHP9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms