Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEF1Q9UBV8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms