Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HDAC6Q9UBN7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC6Q9UBN7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms