Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAE1Q9UBE0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms