Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL13Q9P2N7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL13Q9P2N7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms