Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHMP5Q9NZZ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms