Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPD3Q9NY59 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms