Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX95

SYBU, Syntabulin, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYBUQ9NX95 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYBUQ9NX95 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYBUQ9NX95 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms