Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PANK4Q9NVE7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANK4Q9NVE7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANK4Q9NVE7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANK4Q9NVE7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANK4Q9NVE7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANK4Q9NVE7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANK4Q9NVE7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANK4Q9NVE7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANK4Q9NVE7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PANK4Q9NVE7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PANK4Q9NVE7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms