Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC38A7Q9NVC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A7Q9NVC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms