Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBRD1Q9NUN5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.5 ms