Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXD4L1Q9NU39 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L1Q9NU39 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms