Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB4Q9NTQ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB4Q9NTQ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms