Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTG1Q9NSN8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTG1Q9NSN8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTG1Q9NSN8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms