Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF275Q9NSD4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF275Q9NSD4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms