Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND1Q9NSA2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms