Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTORQ9NRC9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTORQ9NRC9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms