Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL1Q9NR64 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL1Q9NR64 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms