Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAR1AQ9NR31 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAR1AQ9NR31 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms