Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDLIM7Q9NR12 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDLIM7Q9NR12 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms