Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.257e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 PI4KAP1-203ENST00000612500 1869 ntTSL 214.84□□□□□ -0.037e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.691e-6■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 TCF12-222ENST00000561152 675 ntTSL 520.72■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 TCF12-208ENST00000557947 575 ntTSL 416.8■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 TCF12-210ENST00000558908 553 ntTSL 415.06■□□□□ 02e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 211.25□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.577e-7■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 518.57■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 212.03□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 CPED1-208ENST00000495036 2198 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 CPED1-209ENST00000520801 553 ntTSL 48.96□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 CPED1-210ENST00000521774 264 ntTSL 27.17□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 CPED1-204ENST00000428526 2219 ntTSL 26.48□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-218ENST00000530064 625 ntTSL 56.17□□□□□ -1.421e-9■■■■■ 30.7
EXOSC5Q9NQT4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 30.6
EXOSC5Q9NQT4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.486e-7■■■■■ 30.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF700-203ENST00000622593 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 30.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF700-201ENST00000254321 2882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 30.6
EXOSC5Q9NQT4 AC008770.3-203ENST00000591441 677 ntTSL 36.9□□□□□ -1.36e-7■■■■■ 30.6
EXOSC5Q9NQT4 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 30.6
EXOSC5Q9NQT4 TEX10-203ENST00000477648 4457 ntTSL 27.09□□□□□ -1.273e-8■■■■■ 30.6
EXOSC5Q9NQT4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 30.5
EXOSC5Q9NQT4 PAPD7-206ENST00000515721 603 ntTSL 322.03■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 30.5
EXOSC5Q9NQT4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 30.5
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EXOSC5Q9NQT4 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 217.8■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 30.5
EXOSC5Q9NQT4 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 217.07■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 30.5
EXOSC5Q9NQT4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 30.5
EXOSC5Q9NQT4 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 216.5■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 30.5
EXOSC5Q9NQT4 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 213.59□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 30.5
EXOSC5Q9NQT4 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 25.87□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 30.5
EXOSC5Q9NQT4 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.64e-7■■■■■ 30.5
EXOSC5Q9NQT4 PUM3-204ENST00000490444 340 ntTSL 52.56□□□□□ -22e-6■■■■■ 30.5
EXOSC5Q9NQT4 TMEM123-204ENST00000526676 467 ntTSL 412.49□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 30.4
EXOSC5Q9NQT4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 30.4
EXOSC5Q9NQT4 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 30.4
EXOSC5Q9NQT4 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 30.4
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EXOSC5Q9NQT4 TMEM123-206ENST00000529492 549 ntTSL 23.07□□□□□ -1.921e-6■■■■■ 30.4
EXOSC5Q9NQT4 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 42.31□□□□□ -2.041e-6■■■■■ 30.4
EXOSC5Q9NQT4 TMEM123-207ENST00000531103 568 ntTSL 42.02□□□□□ -2.091e-6■■■■■ 30.4
EXOSC5Q9NQT4 MOCOS-201ENST00000261326 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 30.4
EXOSC5Q9NQT4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 ARID1B-201ENST00000319584 2199 ntTSL 211.12□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.39□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 ARID1B-218ENST00000636748 8853 ntTSL 28.06□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 ARID1B-235ENST00000638000 1401 ntTSL 57.54□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 ARID1B-206ENST00000452544 4443 ntTSL 26.32□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 ARID1B-231ENST00000637887 1468 ntTSL 54.88□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 GLMN-205ENST00000495106 1833 ntTSL 1 (best)3.8□□□□□ -1.83e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.043e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 30.3
EXOSC5Q9NQT4 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.675e-8■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 NUDCD3-210ENST00000493613 613 ntTSL 38.15□□□□□ -1.15e-8■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 NUDCD3-203ENST00000460110 3641 ntTSL 1 (best)7.97□□□□□ -1.135e-8■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 NUDCD3-205ENST00000472246 570 ntTSL 47.73□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 NUDCD3-204ENST00000464812 811 ntTSL 57.45□□□□□ -1.225e-8■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-220ENST00000522900 692 ntTSL 314.48□□□□□ -0.097e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-221ENST00000523814 802 ntTSL 513.08□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-204ENST00000517824 849 ntTSL 59.35□□□□□ -0.917e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-218ENST00000522222 585 ntTSL 45.8□□□□□ -1.487e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.696e-8■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.726e-8■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.796e-8■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-215ENST00000469481 989 ntTSL 312.55□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-213ENST00000458700 296 ntTSL 512.52□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 STAG2-212ENST00000458176 845 ntTSL 312.39□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 MIR4527HG-201ENST00000586905 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 30.2
EXOSC5Q9NQT4 CNIH1-206ENST00000557659 856 ntTSL 29.33□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 30.2
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