Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN3Q9NQS3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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