Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED4Q9NPJ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms