Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM138Q9NPI0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM138Q9NPI0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms