Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRMS1Q9HCU9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRMS1Q9HCU9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms