Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A3Q9HC58 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC24A3Q9HC58 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms