Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK4Q9HAZ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLK4Q9HAZ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms