Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NHEJ1Q9H9Q4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NHEJ1Q9H9Q4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms