Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD3Q9H7B4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD3Q9H7B4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.1 ms