Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSS3Q9H6R3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms