Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC86Q9H6F5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC86Q9H6F5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC86Q9H6F5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC86Q9H6F5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC86Q9H6F5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC86Q9H6F5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC86Q9H6F5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC86Q9H6F5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC86Q9H6F5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC86Q9H6F5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms