Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
SENP3Q9H4L4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SENP3Q9H4L4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms