Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4G0

EPB41L1, Band 4.1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L1Q9H4G0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L1Q9H4G0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB41L1Q9H4G0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L1Q9H4G0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms