Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF3Q9H4D5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF3Q9H4D5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF3Q9H4D5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF3Q9H4D5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF3Q9H4D5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF3Q9H4D5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF3Q9H4D5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF3Q9H4D5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF3Q9H4D5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NXF3Q9H4D5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms