Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL25Q9H0H3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL25Q9H0H3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL25Q9H0H3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL25Q9H0H3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL25Q9H0H3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms