Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT23Q9C075 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms