Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM4Q9C037 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms