Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GABARAPL3Q9BY60 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms