Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC8Q9BY41 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC8Q9BY41 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms