Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP58Q9BVL2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms